Rearrange AST class structure to use inner class definitions

Change how start conditions are represented in the syntax tree

Fix minor bugs (missing/misplaced markup)

Remove RegexGroup markup around the expression to be matched, so that we simply generate two expressions, the expression to be matched and the trailing context

Change inner loops to use int not YY_CHAR, removing need for separate NUL table

Change the generated output, to make it readable by element.deserialize(), etc

Tighten up <Rule>...</Rule> so it does not pull in the inter-token space before

Implement proper options markup, tidy up <Rule>...<Action>...</Action</Rule>

Modify so that the scanner inserts the <SectN>...</SectN> markup, make sect 3 have proper markup, and update the markup system from latest bootstrap_bison.git

Fix a bug of including extra yytext after isolated action (blank/comment line)

Fix a bug in code that executes when <token value="NNN">...</token> is disabled

Add a forgotten section of src/Makefile.patch

First cut at modified flex that operates normally but also writes a scanned, parsed and marked up version of the input file to stderr in XML format (had to run autogen.sh for some reason so the configure, Makefile.in etc have also changed)

Implement ./n.sh instead of ./configure which will auto-patch src/Makefile

Make it buffer the pieces in memory (in a stack) and reduce it down to a single piece in the parser stage, so that the parser stage can also insert XML tags

Make it add markup around code: <CodeBlock>, <Action> and <PercentBraceAction>

Modified flex-2.6.4 to output XML to stderr showing token values and boundaries

Pristine copy of flex-2.6.4